En lo que respecta al territorio en sí, este es bastante accidentado presentando nevadas cumbres y quebradas muy profundas resultados de una erosión fluvio- glaciar y por tanto, un gran número de lagunas.
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El área presenta siete zonas de vida que albergan un amplio espectro de microclimas, lo que hace un mosaico de diversos tipos de vegetación íntimamente ligados entre sí. Se han identificado 779 especies de flora altoandina distribuidas en 340 géneros y 104 familias. En esta diversidad florística, la familia de las Bromeliáceas está representada por la Puya Raimondi, especie que tiene la inflorescencia más grande del mundo. Allí también se encuentran bosques relictos y numerosas gramíneas que conforman el pajonal de puna.

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